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Collaborations

Publications

 

Stages réalisés

Génétique moléculaire de la légumineuse modèle Medicago truncatula
(groupe de recherche de Thierry HUGUET)

 

L'objectif du groupe est d'exploiter les variations naturelles existantes dans les populations de la légumineuse modèle Medicago truncatula en vue d'identifier et de cloner des gènes et des QTLs d'intérêt agronomique.

 

Création de populations recombinantes
Notre stratégie est de sélectionner un nombre limité de lignées sauvages polymorphes, de les croiser et de créer des Lignées Recombinantes (RILs). Ce travail a été réalisé en collaboration avec J.M. Prospéri, INRA, Montpellier, France. Deux populations de RILs au stade F6/F7 ont déjà été obtenues. La création de lignées d'introgression est en cours.

 

Cartographie génétique
Nous avons construit une carte génétique basée sur une population de RILs résultant du croisement entre une lignée algérienne (DZA315.16) et le cultivar Jemalong. Cette carte comprend actuellement 600 marqueurs et couvre 1000cM sur 8 groupes de liaison (2n=16). Deux autres cartes génétiques cadres ont été construites pour la recherche de QTLs.

Marqueurs microsatellites (SSR)
Nous privilégions ces marqueurs car ils sont abondants et polymorphes ce qui les rend très utiles pour la cartographie génétique et les études de diversité. Nous avons développé un jeu de SSRs identifiés dans les séquences des ESTs ce qui permet d'avoir une carte génétique ancrée dans le génome exprimé. Ces microsatellites sont utilisés pour créer une carte génétique consensus à partir de plusieurs croisements (collaboration: N. Young, UMN, StPaul, USA).

Polymorphisme entre 11 lignées de M. truncatula pour un marqueur microsatellite

Diversité de forme et de marques foliaires chez M. trunactula
(en haut à gauche:Jemalong)

Recherche de diversité
Les lignées références sont systématiquement criblées pour leur polymorphisme vis à vis de certains caractères comme la morphologie, le développement, la floraison, la symbiose ou la tolérance aux stress abiotiques ou biotiques. Le déterminisme génétique de ces caractères est étudié avec les RILs. Nous avons déjà identifié et cartographié 2 gènes relatifs à la morphologie: le sens d'enroulement des gousses (SPC) et la présence de marques foliaires (LFM).

 

Génétique de la symbiose Rhizobium-légumineuses
Nous avons identifié et cartographié 2 gènes symbiotiques: Mtsym3 qui pourrait être impliqué dans la reconnaissance des facteurs Nod et Mtsym6 qui est impliqué dans la spécificité souche-cultivar entre la bactérie et la plante hôte.

 

Tolérance aux stress abiotiques
Notre groupe étudie les bases génétiques et moléculaires de la tolérance à la salinité et à la sécheresse des M. truncatula, en condition de symbiose ou non (collaboration: M. Crespi, ISV, Gif sur Yvette, France; M.E. Aouni, INRST, Hammam-Lif, Tunisie; A. Abdelguerfi, INA, Alger, Algérie).


 

Collaborations:

 

Laboratoire des Interactions Plantes Microorganismes, INRA, Auzeville Tolosane

J.M. Prospéri, INRA, Montpellier, France

N. Young, UMN, StPaul, USA

M. Crespi, ISV, Gif sur Yvette, France; M.E. Aouni, INRST, Hammam-Lif, Tunisie; A. Abdelguerfi, INA, Alger, Algérie

Publications:

 

 
Stages réalisés